卡美拉与卡欧斯决战后的冬天,北海道降下流星雨,其中一颗坠落在支笏湖南西方约一公里处,陆上自在刺眼的红灯闪烁,和刺耳的警告声中,飞船厚实的大门缓缓合上,将外面数百只巨鸟隔绝在飞船外面,但有那几只不知道是傻,还是凶戾的怪鸟还留在飞船大厅里没有及时出来,当飞船厚重的大门缓缓合上的时候,那三五只凶猛的傻鸟就被关在了飞船的大厅里。卫队第11师团随即派出化学防护小队,渡良瀬佑介二佐与花谷陆尉深入调查,发现到了是陨石坠落。
五天后,事件的原凶开始现身,札幌市地下铁的电车在隧道内被不明生物攻击,北海道札幌市的薄野出现巨大植物,巨大植物窜出一群体长3m,类似昆虫的甲壳类生物。
怪虫(Legion)与植物是与流星一起飞来的地球外物体,两者属共生关系,Legion会借由啃食硅酮并分泌氧气来制造植物(草体),在这种高浓度氧的环境下,地球生物绝对无法生存,自卫队决定用爆破处理草体。此时海上自卫队探测到卡美拉往札幌飞去......